Matteo Contini nasce a Gemonio (Varese) 16 aprile 1980).

Attulmente gioca nel Napoli nel ruolo di difensore.

Inizia la carriera calcistica nelle giovanili del Milan, e nella stagione 1998-1999 è ceduto in prestito alla Lumezzane con cui gioca 11 partite nel campionato della Serie C1. L'anno successivo il Milan decide di prestarlo al Livorno, sempre in Serie C1, e questa volta le presenze sono 15. Nella Stagione 2000-2001 passa, ancora in prestito ed ancora in C1, alla Spal, dove disputa 17 partite. La stagione successiva gioca 25 partite col Monza, nuovo possessore del suo cartellino. Contini viene poi ceduto all'Aquila dove nel campionato di C1 2002-2003 realizza 2 reti in 31 presenze .

Passa poi all'Avellino, in Serie B. Con l'allenatore Zdenek Zeman e diviene titolare, gioca 39 partite segnando un gol.

Il 26 settembre 2004 esordisce in Serie A con il Parma (nella partita Inter-Parma 2-2), dove rimane per tre stagioni, prima di trasferirsi, il 16 agosto 2007, per una cifra vicina ai 3 milioni e 500 mila euro, al Napoli dove firma un contratto quinquennale.